Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SCARF1Q14162 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SCARF1Q14162 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCARF1Q14162 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
SCARF1Q14162 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
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