Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAPGEF1Q13905 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAPGEF1Q13905 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAPGEF1Q13905 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAPGEF1Q13905 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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