Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCNQ0VAF6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms