Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTK2Q05397 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTK2Q05397 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTK2Q05397 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTK2Q05397 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms