Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH2Q04721 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH2Q04721 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH2Q04721 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH2Q04721 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH2Q04721 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH2Q04721 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH2Q04721 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH2Q04721 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH2Q04721 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH2Q04721 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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