Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF90Q03938 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF90Q03938 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms