Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
NUCB1Q02818 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NUCB1Q02818 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUCB1Q02818 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NUCB1Q02818 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms