Protein–RNA interactions for Protein: P62502

LCN6, Epididymal-specific lipocalin-6, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN6P62502 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN6P62502 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN6P62502 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN6P62502 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN6P62502 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN6P62502 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN6P62502 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN6P62502 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN6P62502 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN6P62502 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN6P62502 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN6P62502 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN6P62502 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN6P62502 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN6P62502 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN6P62502 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN6P62502 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN6P62502 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN6P62502 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN6P62502 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN6P62502 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN6P62502 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN6P62502 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN6P62502 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN6P62502 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN6P62502 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN6P62502 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCN6P62502 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCN6P62502 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCN6P62502 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCN6P62502 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCN6P62502 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN6P62502 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN6P62502 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN6P62502 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN6P62502 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN6P62502 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN6P62502 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCN6P62502 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCN6P62502 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN6P62502 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN6P62502 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN6P62502 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN6P62502 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN6P62502 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN6P62502 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN6P62502 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN6P62502 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN6P62502 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN6P62502 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN6P62502 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN6P62502 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN6P62502 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN6P62502 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCN6P62502 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN6P62502 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN6P62502 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN6P62502 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN6P62502 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN6P62502 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN6P62502 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN6P62502 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN6P62502 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN6P62502 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN6P62502 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN6P62502 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN6P62502 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN6P62502 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN6P62502 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN6P62502 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN6P62502 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN6P62502 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN6P62502 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN6P62502 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN6P62502 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN6P62502 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN6P62502 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN6P62502 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN6P62502 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN6P62502 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN6P62502 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN6P62502 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN6P62502 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN6P62502 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms