Protein–RNA interactions for Protein: P62502

LCN6, Epididymal-specific lipocalin-6, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN6P62502 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LCN6P62502 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LCN6P62502 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LCN6P62502 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LCN6P62502 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LCN6P62502 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCN6P62502 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LCN6P62502 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LCN6P62502 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LCN6P62502 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LCN6P62502 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LCN6P62502 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LCN6P62502 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCN6P62502 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCN6P62502 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCN6P62502 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCN6P62502 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LCN6P62502 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LCN6P62502 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCN6P62502 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCN6P62502 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCN6P62502 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCN6P62502 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCN6P62502 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCN6P62502 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCN6P62502 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LCN6P62502 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LCN6P62502 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCN6P62502 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LCN6P62502 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LCN6P62502 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCN6P62502 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LCN6P62502 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCN6P62502 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCN6P62502 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCN6P62502 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCN6P62502 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCN6P62502 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCN6P62502 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCN6P62502 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCN6P62502 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCN6P62502 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCN6P62502 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCN6P62502 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCN6P62502 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCN6P62502 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCN6P62502 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCN6P62502 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCN6P62502 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCN6P62502 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCN6P62502 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LCN6P62502 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCN6P62502 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCN6P62502 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCN6P62502 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCN6P62502 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCN6P62502 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCN6P62502 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCN6P62502 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCN6P62502 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCN6P62502 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LCN6P62502 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCN6P62502 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCN6P62502 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCN6P62502 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCN6P62502 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCN6P62502 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCN6P62502 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCN6P62502 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCN6P62502 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCN6P62502 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCN6P62502 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCN6P62502 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCN6P62502 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCN6P62502 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCN6P62502 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCN6P62502 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCN6P62502 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCN6P62502 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCN6P62502 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCN6P62502 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN6P62502 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN6P62502 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCN6P62502 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCN6P62502 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCN6P62502 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCN6P62502 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCN6P62502 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LCN6P62502 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN6P62502 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCN6P62502 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCN6P62502 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCN6P62502 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCN6P62502 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCN6P62502 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN6P62502 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN6P62502 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCN6P62502 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCN6P62502 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCN6P62502 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms