Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LMAN1P49257 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMAN1P49257 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMAN1P49257 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms