Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRATP43155 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRATP43155 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRATP43155 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRATP43155 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRATP43155 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRATP43155 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRATP43155 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRATP43155 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRATP43155 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRATP43155 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRATP43155 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRATP43155 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRATP43155 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRATP43155 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRATP43155 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRATP43155 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRATP43155 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRATP43155 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRATP43155 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CRATP43155 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRATP43155 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRATP43155 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRATP43155 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRATP43155 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRATP43155 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRATP43155 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRATP43155 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CRATP43155 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRATP43155 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRATP43155 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRATP43155 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRATP43155 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRATP43155 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRATP43155 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRATP43155 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRATP43155 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRATP43155 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRATP43155 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRATP43155 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRATP43155 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRATP43155 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRATP43155 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRATP43155 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRATP43155 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRATP43155 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRATP43155 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRATP43155 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRATP43155 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRATP43155 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRATP43155 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CRATP43155 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRATP43155 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRATP43155 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRATP43155 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRATP43155 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRATP43155 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRATP43155 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRATP43155 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRATP43155 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRATP43155 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRATP43155 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRATP43155 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRATP43155 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRATP43155 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRATP43155 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRATP43155 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRATP43155 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRATP43155 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRATP43155 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRATP43155 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRATP43155 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRATP43155 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRATP43155 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRATP43155 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRATP43155 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRATP43155 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRATP43155 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRATP43155 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRATP43155 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRATP43155 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRATP43155 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRATP43155 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRATP43155 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRATP43155 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRATP43155 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRATP43155 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRATP43155 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRATP43155 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRATP43155 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRATP43155 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms