Protein–RNA interactions for Protein: P42677

RPS27, 40S ribosomal protein S27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27P42677 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27P42677 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27P42677 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27P42677 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27P42677 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27P42677 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27P42677 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27P42677 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27P42677 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27P42677 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27P42677 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27P42677 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27P42677 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27P42677 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27P42677 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27P42677 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27P42677 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27P42677 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27P42677 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27P42677 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27P42677 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27P42677 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27P42677 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27P42677 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27P42677 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27P42677 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27P42677 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS27P42677 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27P42677 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27P42677 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27P42677 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27P42677 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27P42677 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27P42677 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27P42677 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27P42677 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27P42677 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27P42677 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27P42677 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27P42677 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27P42677 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27P42677 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27P42677 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27P42677 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27P42677 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27P42677 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27P42677 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27P42677 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27P42677 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27P42677 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27P42677 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27P42677 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27P42677 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27P42677 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27P42677 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27P42677 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27P42677 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27P42677 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS27P42677 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27P42677 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27P42677 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27P42677 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27P42677 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27P42677 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27P42677 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27P42677 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27P42677 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27P42677 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27P42677 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27P42677 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27P42677 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27P42677 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27P42677 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27P42677 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27P42677 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27P42677 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27P42677 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27P42677 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27P42677 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27P42677 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27P42677 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27P42677 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27P42677 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27P42677 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS27P42677 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS27P42677 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27P42677 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27P42677 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27P42677 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27P42677 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27P42677 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27P42677 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27P42677 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27P42677 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27P42677 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27P42677 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27P42677 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27P42677 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27P42677 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27P42677 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms