Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC26A3P40879 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC26A3P40879 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms