Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJC1P36383 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJC1P36383 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJC1P36383 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJC1P36383 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJC1P36383 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJC1P36383 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJC1P36383 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJC1P36383 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJC1P36383 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GJC1P36383 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJC1P36383 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJC1P36383 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJC1P36383 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJC1P36383 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJC1P36383 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJC1P36383 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJC1P36383 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GJC1P36383 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJC1P36383 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJC1P36383 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJC1P36383 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GJC1P36383 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJC1P36383 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJC1P36383 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GJC1P36383 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJC1P36383 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJC1P36383 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJC1P36383 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJC1P36383 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJC1P36383 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJC1P36383 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJC1P36383 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJC1P36383 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJC1P36383 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJC1P36383 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJC1P36383 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJC1P36383 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJC1P36383 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJC1P36383 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJC1P36383 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GJC1P36383 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJC1P36383 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJC1P36383 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJC1P36383 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJC1P36383 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJC1P36383 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJC1P36383 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJC1P36383 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJC1P36383 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJC1P36383 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJC1P36383 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJC1P36383 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJC1P36383 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJC1P36383 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJC1P36383 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJC1P36383 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJC1P36383 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJC1P36383 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJC1P36383 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJC1P36383 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJC1P36383 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJC1P36383 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJC1P36383 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJC1P36383 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJC1P36383 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJC1P36383 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GJC1P36383 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJC1P36383 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJC1P36383 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJC1P36383 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJC1P36383 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJC1P36383 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJC1P36383 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJC1P36383 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJC1P36383 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJC1P36383 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJC1P36383 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJC1P36383 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJC1P36383 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJC1P36383 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJC1P36383 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJC1P36383 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJC1P36383 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJC1P36383 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJC1P36383 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJC1P36383 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJC1P36383 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJC1P36383 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJC1P36383 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJC1P36383 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms