Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP1P29466 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP1P29466 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP1P29466 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP1P29466 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP1P29466 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP1P29466 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP1P29466 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP1P29466 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP1P29466 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP1P29466 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP1P29466 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP1P29466 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP1P29466 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP1P29466 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP1P29466 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP1P29466 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP1P29466 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP1P29466 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP1P29466 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP1P29466 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP1P29466 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP1P29466 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP1P29466 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP1P29466 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP1P29466 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASP1P29466 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASP1P29466 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP1P29466 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP1P29466 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP1P29466 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP1P29466 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP1P29466 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP1P29466 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP1P29466 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP1P29466 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP1P29466 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP1P29466 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP1P29466 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP1P29466 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP1P29466 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP1P29466 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP1P29466 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP1P29466 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP1P29466 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP1P29466 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP1P29466 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP1P29466 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP1P29466 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP1P29466 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP1P29466 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP1P29466 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP1P29466 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP1P29466 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP1P29466 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP1P29466 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP1P29466 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP1P29466 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP1P29466 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP1P29466 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP1P29466 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP1P29466 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP1P29466 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP1P29466 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP1P29466 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP1P29466 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP1P29466 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP1P29466 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP1P29466 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP1P29466 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP1P29466 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP1P29466 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP1P29466 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP1P29466 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP1P29466 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP1P29466 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP1P29466 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP1P29466 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP1P29466 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP1P29466 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP1P29466 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP1P29466 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP1P29466 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP1P29466 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP1P29466 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP1P29466 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP1P29466 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP1P29466 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP1P29466 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP1P29466 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP1P29466 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP1P29466 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP1P29466 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP1P29466 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP1P29466 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP1P29466 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP1P29466 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CASP1P29466 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASP1P29466 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP1P29466 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms