Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRB3P28472 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABRB3P28472 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB3P28472 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms