Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 RAI1-205ENST00000582514 878 ntTSL 221.18■□□□□ 0.988e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.978e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.978e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.88e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.744e-9■■■■■ 45.6
RPS3P23396 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.568e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.528e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.474e-9■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-213ENST00000595897 2973 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 NOL6-205ENST00000464829 1829 ntTSL 215.83■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 GRPEL1-202ENST00000504920 2195 ntTSL 215.27■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-211ENST00000595723 872 ntTSL 515.27■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-212ENST00000567193 915 ntTSL 215.08■□□□□ 08e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ATRAID-205ENST00000484646 548 ntTSL 214.97□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 METTL7A-204ENST00000550097 1846 ntTSL 514.65□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-204ENST00000563168 1525 ntTSL 214.31□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 314.3□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-203ENST00000562235 775 ntTSL 213.1□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-206ENST00000594044 834 ntTSL 513.04□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 METTL7A-202ENST00000547104 1825 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 MACROD1-204ENST00000541041 230 ntTSL 312.87□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-205ENST00000563271 614 ntTSL 212.37□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 GRPEL1-203ENST00000509696 884 ntTSL 212.12□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 NOL6-201ENST00000297990 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.518e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-202ENST00000517383 686 ntTSL 311.81□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-209ENST00000564649 514 ntTSL 211.66□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-207ENST00000520316 692 ntTSL 211.5□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-210ENST00000565201 832 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-205ENST00000520005 588 ntTSL 310.99□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 GRPEL1-201ENST00000264954 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-213ENST00000521777 2430 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-211ENST00000521022 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-218ENST00000524103 1914 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.748e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-204ENST00000519578 578 ntTSL 310.05□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 STOML2-204ENST00000488050 904 ntTSL 510.04□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 MACROD1-202ENST00000538042 264 ntTSL 210.01□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TMEM208-206ENST00000563426 457 ntTSL 39.95□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 NOL6-202ENST00000353159 3411 ntTSL 1 (best)9.91□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-217ENST00000523303 2578 ntTSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.848e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.888e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.888e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 METTL7A-201ENST00000332160 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.998e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 CTNNA1-221ENST00000520339 868 ntTSL 38.88□□□□□ -0.998e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-204ENST00000518112 2059 ntTSL 28.85□□□□□ -0.998e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.018e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 SP1-203ENST00000548560 1061 ntTSL 28.51□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 CTNNA1-231ENST00000521941 224 ntTSL 38.13□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 INTS9-215ENST00000522363 2045 ntTSL 28.11□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-216ENST00000523687 1923 ntTSL 28.03□□□□□ -1.128e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-205ENST00000519261 1924 ntTSL 27.94□□□□□ -1.148e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PRPS2-204ENST00000461630 891 ntTSL 1 (best)7.8□□□□□ -1.168e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 ELP3-207ENST00000520110 779 ntTSL 36.61□□□□□ -1.358e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 CTNNA1-241ENST00000524127 483 ntTSL 44.79□□□□□ -1.648e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 KCTD8-202ENST00000515268 464 ntTSL 32.32□□□□□ -2.048e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PAFAH1B2-201ENST00000304808 821 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PAFAH1B2-203ENST00000526888 1099 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.822e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 45.6
RPS3P23396 HMGCL-202ENST00000374487 2151 ntTSL 211.9□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 45.6
RPS3P23396 HMGCL-204ENST00000436439 1354 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 45.6
RPS3P23396 HMGCL-201ENST00000235958 1101 ntTSL 510.01□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 45.6
RPS3P23396 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.898e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 GPN3-205ENST00000547323 541 ntTSL 320.47■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ARMC1-205ENST00000523384 507 ntTSL 320.28■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 RPUSD3-210ENST00000460909 578 ntTSL 220.17■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ARMC1-204ENST00000519352 686 ntTSL 219.89■□□□□ 0.778e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)19.77■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 RPUSD3-213ENST00000472381 823 ntTSL 519.26■□□□□ 0.678e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 GPN3-210ENST00000552180 640 ntTSL 318.89■□□□□ 0.618e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-215ENST00000576496 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-211ENST00000573699 864 ntTSL 318.69■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 RPUSD3-207ENST00000433555 807 ntTSL 318.46■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-213ENST00000574841 510 ntTSL 218.07■□□□□ 0.488e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 218.02■□□□□ 0.488e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 45.5
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