RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304800.13

TMEM208-201, Transcript of transmembrane protein 208, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM208, Length 793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208-201ENST00000304800 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.49■■■■□ 3.11
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TMEM208-201ENST00000304800 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.05■■■□□ 2.24
TMEM208-201ENST00000304800 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.01■■■□□ 2.23
TMEM208-201ENST00000304800 NACADO15069 1562 aa28.88■■■□□ 2.21
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TMEM208-201ENST00000304800 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.53■■■□□ 2.16
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TMEM208-201ENST00000304800 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM208-201ENST00000304800 SCRIBQ14160 1630 aa28.18■■■□□ 2.1
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TMEM208-201ENST00000304800 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.31■■□□□ 1.96
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TMEM208-201ENST00000304800 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.68■■□□□ 1.86
TMEM208-201ENST00000304800 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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TMEM208-201ENST00000304800 SMARCA2P51531 1590 aa26.6■■□□□ 1.85
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TMEM208-201ENST00000304800 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TMEM208-201ENST00000304800 ERCC6Q03468 1493 aa26.17■■□□□ 1.78
TMEM208-201ENST00000304800 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.01■■□□□ 1.75
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TMEM208-201ENST00000304800 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.92■■□□□ 1.74
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TMEM208-201ENST00000304800 CUX2O14529 1486 aa25.88■■□□□ 1.73
TMEM208-201ENST00000304800 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.82■■□□□ 1.72
TMEM208-201ENST00000304800 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM208-201ENST00000304800 CFTRP13569 1480 aa25.72■■□□□ 1.71
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TMEM208-201ENST00000304800 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.64■■□□□ 1.69
TMEM208-201ENST00000304800 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.63■■□□□ 1.69
TMEM208-201ENST00000304800 WDR62O43379 1518 aa25.58■■□□□ 1.68
TMEM208-201ENST00000304800 PRDM2Q13029 1718 aa25.54■■□□□ 1.68
TMEM208-201ENST00000304800 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TMEM208-201ENST00000304800 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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TMEM208-201ENST00000304800 TOPBP1Q92547 1522 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM208-201ENST00000304800 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.16■■□□□ 1.62
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TMEM208-201ENST00000304800 IFT140Q96RY7 1462 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM208-201ENST00000304800 ABCC8Q09428 1581 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM208-201ENST00000304800 CUX1P39880 1505 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM208-201ENST00000304800 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TMEM208-201ENST00000304800 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.02■■□□□ 1.6
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TMEM208-201ENST00000304800 SOGA1O94964 1423 aa24.88■■□□□ 1.57
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TMEM208-201ENST00000304800 OSCARQ8IYS5 282 aa24.81■■□□□ 1.56
TMEM208-201ENST00000304800 CHD1O14646 1710 aa24.77■■□□□ 1.56
TMEM208-201ENST00000304800 SYNJ1O43426 1573 aa24.76■■□□□ 1.55
TMEM208-201ENST00000304800 WDR97A6NE52 1622 aa24.75■■□□□ 1.55
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TMEM208-201ENST00000304800 FBLN2P98095 1184 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM208-201ENST00000304800 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.68■■□□□ 1.54
TMEM208-201ENST00000304800 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.67■■□□□ 1.54
TMEM208-201ENST00000304800 TOP2BQ02880 1626 aa24.66■■□□□ 1.54
TMEM208-201ENST00000304800 TRIM41Q8WV44 630 aa24.66■■□□□ 1.54
TMEM208-201ENST00000304800 PBRM1Q86U86 1689 aa24.62■■□□□ 1.53
TMEM208-201ENST00000304800 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.61■■□□□ 1.53
TMEM208-201ENST00000304800 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM208-201ENST00000304800 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM208-201ENST00000304800 GRIN2BQ13224 1484 aa24.58■■□□□ 1.53
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TMEM208-201ENST00000304800 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM208-201ENST00000304800 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM208-201ENST00000304800 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TMEM208-201ENST00000304800 ARHGEF11O15085 1522 aa24.5■■□□□ 1.51
TMEM208-201ENST00000304800 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TMEM208-201ENST00000304800 SYNJ2O15056 1496 aa24.45■■□□□ 1.51
TMEM208-201ENST00000304800 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.4■■□□□ 1.5
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TMEM208-201ENST00000304800 ARAP1Q96P48 1450 aa24.32■■□□□ 1.48
TMEM208-201ENST00000304800 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.31■■□□□ 1.48
TMEM208-201ENST00000304800 GRIN2AQ12879 1464 aa24.3■■□□□ 1.48
TMEM208-201ENST00000304800 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.28■■□□□ 1.48
TMEM208-201ENST00000304800 CEP170Q5SW79 1584 aa24.28■■□□□ 1.48
TMEM208-201ENST00000304800 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.25■■□□□ 1.47
TMEM208-201ENST00000304800 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.21■■□□□ 1.47
TMEM208-201ENST00000304800 NUP160Q12769 1436 aa24.18■■□□□ 1.46
TMEM208-201ENST00000304800 IGF1RP08069 1367 aa24.15■■□□□ 1.46
TMEM208-201ENST00000304800 KIF27Q86VH2 1401 aa24.13■■□□□ 1.45
TMEM208-201ENST00000304800 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM208-201ENST00000304800 SHROOM2Q13796 1616 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM208-201ENST00000304800 CUL7Q14999 1698 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM208-201ENST00000304800 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.97■■□□□ 1.43
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