RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563271.5

TMEM208-205, Transcript of transmembrane protein 208, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM208, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208-205ENST00000563271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.58■■■□□ 2.65
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TMEM208-205ENST00000563271 ABCC9O60706 1549 aa27.98■■■□□ 2.07
TMEM208-205ENST00000563271 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM208-205ENST00000563271 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.67■■□□□ 1.86
TMEM208-205ENST00000563271 NACADO15069 1562 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM208-205ENST00000563271 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.24■■□□□ 1.79
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TMEM208-205ENST00000563271 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.03■■□□□ 1.76
TMEM208-205ENST00000563271 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.92■■□□□ 1.74
TMEM208-205ENST00000563271 SCRIBQ14160 1630 aa25.75■■□□□ 1.71
TMEM208-205ENST00000563271 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.46■■□□□ 1.67
TMEM208-205ENST00000563271 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM208-205ENST00000563271 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TMEM208-205ENST00000563271 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.14■■□□□ 1.61
TMEM208-205ENST00000563271 SMARCA4P51532 1647 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM208-205ENST00000563271 NCAPD3P42695 1498 aa24.54■■□□□ 1.52
TMEM208-205ENST00000563271 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.52■■□□□ 1.52
TMEM208-205ENST00000563271 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TMEM208-205ENST00000563271 SMARCA2P51531 1590 aa24.43■■□□□ 1.5
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TMEM208-205ENST00000563271 HMGXB3Q12766 1538 aa24.33■■□□□ 1.49
TMEM208-205ENST00000563271 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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TMEM208-205ENST00000563271 NESP48681 1621 aa24.13■■□□□ 1.45
TMEM208-205ENST00000563271 WIZO95785 1651 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM208-205ENST00000563271 ERCC6Q03468 1493 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM208-205ENST00000563271 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
TMEM208-205ENST00000563271 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.91■■□□□ 1.42
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TMEM208-205ENST00000563271 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.78■■□□□ 1.4
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TMEM208-205ENST00000563271 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
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TMEM208-205ENST00000563271 CFTRP13569 1480 aa23.6■■□□□ 1.37
TMEM208-205ENST00000563271 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM208-205ENST00000563271 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM208-205ENST00000563271 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM208-205ENST00000563271 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.53■■□□□ 1.36
TMEM208-205ENST00000563271 WDR62O43379 1518 aa23.47■■□□□ 1.35
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TMEM208-205ENST00000563271 PRDM2Q13029 1718 aa23.35■■□□□ 1.33
TMEM208-205ENST00000563271 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM208-205ENST00000563271 TOPBP1Q92547 1522 aa23.15■■□□□ 1.3
TMEM208-205ENST00000563271 ABCC8Q09428 1581 aa23.08■■□□□ 1.29
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TMEM208-205ENST00000563271 IFT140Q96RY7 1462 aa23.05■■□□□ 1.28
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TMEM208-205ENST00000563271 SOGA1O94964 1423 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM208-205ENST00000563271 CUX1P39880 1505 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM208-205ENST00000563271 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TMEM208-205ENST00000563271 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM208-205ENST00000563271 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TMEM208-205ENST00000563271 TRIM41Q8WV44 630 aa22.81■■□□□ 1.24
TMEM208-205ENST00000563271 FBLN2P98095 1184 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM208-205ENST00000563271 CHD1O14646 1710 aa22.68■■□□□ 1.22
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TMEM208-205ENST00000563271 WDR97A6NE52 1622 aa22.6■■□□□ 1.21
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TMEM208-205ENST00000563271 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TMEM208-205ENST00000563271 GRIN2BQ13224 1484 aa22.59■■□□□ 1.21
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TMEM208-205ENST00000563271 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.58■■□□□ 1.21
TMEM208-205ENST00000563271 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.58■■□□□ 1.21
TMEM208-205ENST00000563271 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.57■■□□□ 1.2
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TMEM208-205ENST00000563271 SYNJ1O43426 1573 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM208-205ENST00000563271 TOP2BQ02880 1626 aa22.55■■□□□ 1.2
TMEM208-205ENST00000563271 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.53■■□□□ 1.2
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TMEM208-205ENST00000563271 ARHGEF11O15085 1522 aa22.52■■□□□ 1.2
TMEM208-205ENST00000563271 PBRM1Q86U86 1689 aa22.51■■□□□ 1.19
TMEM208-205ENST00000563271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.48■■□□□ 1.19
TMEM208-205ENST00000563271 SYNJ2O15056 1496 aa22.47■■□□□ 1.19
TMEM208-205ENST00000563271 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.46■■□□□ 1.19
TMEM208-205ENST00000563271 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.38■■□□□ 1.17
TMEM208-205ENST00000563271 ARAP1Q96P48 1450 aa22.34■■□□□ 1.17
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TMEM208-205ENST00000563271 ADAMTS12P58397 1594 aa22.29■■□□□ 1.16
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TMEM208-205ENST00000563271 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM208-205ENST00000563271 CEP170Q5SW79 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
TMEM208-205ENST00000563271 NUP160Q12769 1436 aa22.2■■□□□ 1.14
TMEM208-205ENST00000563271 IGF1RP08069 1367 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM208-205ENST00000563271 KIF27Q86VH2 1401 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM208-205ENST00000563271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM208-205ENST00000563271 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM208-205ENST00000563271 JPH4Q96JJ6 628 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM208-205ENST00000563271 SHROOM2Q13796 1616 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM208-205ENST00000563271 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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