RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.04■■■■■ 5.6
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RPUSD3-210ENST00000460909 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
RPUSD3-210ENST00000460909 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.71■■■■■ 4.27
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RPUSD3-210ENST00000460909 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.44■■■■□ 3.74
RPUSD3-210ENST00000460909 HMGXB3Q12766 1538 aa38.33■■■■□ 3.73
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RPUSD3-210ENST00000460909 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.17■■■■□ 3.54
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RPUSD3-210ENST00000460909 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.81■■■■□ 3.16
RPUSD3-210ENST00000460909 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.81■■■■□ 3.16
RPUSD3-210ENST00000460909 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.64■■■■□ 3.14
RPUSD3-210ENST00000460909 SHROOM2Q13796 1616 aa34.63■■■■□ 3.13
RPUSD3-210ENST00000460909 PRXQ9BXM0 1461 aa34.58■■■■□ 3.13
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