Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN1P21941 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN1P21941 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN1P21941 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN1P21941 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN1P21941 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN1P21941 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN1P21941 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN1P21941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN1P21941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN1P21941 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN1P21941 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN1P21941 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN1P21941 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN1P21941 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN1P21941 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN1P21941 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN1P21941 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN1P21941 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN1P21941 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN1P21941 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN1P21941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MATN1P21941 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MATN1P21941 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN1P21941 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN1P21941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN1P21941 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN1P21941 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN1P21941 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MATN1P21941 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MATN1P21941 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MATN1P21941 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MATN1P21941 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MATN1P21941 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MATN1P21941 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MATN1P21941 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MATN1P21941 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MATN1P21941 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN1P21941 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN1P21941 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN1P21941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN1P21941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN1P21941 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN1P21941 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN1P21941 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN1P21941 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN1P21941 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN1P21941 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN1P21941 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN1P21941 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN1P21941 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN1P21941 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN1P21941 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN1P21941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN1P21941 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN1P21941 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN1P21941 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN1P21941 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN1P21941 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN1P21941 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN1P21941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN1P21941 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN1P21941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN1P21941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MATN1P21941 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MATN1P21941 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN1P21941 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN1P21941 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN1P21941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN1P21941 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN1P21941 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN1P21941 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN1P21941 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN1P21941 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN1P21941 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN1P21941 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN1P21941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN1P21941 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN1P21941 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN1P21941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN1P21941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN1P21941 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN1P21941 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN1P21941 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN1P21941 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN1P21941 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN1P21941 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN1P21941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN1P21941 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN1P21941 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN1P21941 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN1P21941 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN1P21941 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN1P21941 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN1P21941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN1P21941 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN1P21941 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN1P21941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN1P21941 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN1P21941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms