Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD53P19397 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD53P19397 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD53P19397 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD53P19397 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD53P19397 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD53P19397 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD53P19397 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD53P19397 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD53P19397 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD53P19397 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD53P19397 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD53P19397 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD53P19397 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD53P19397 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD53P19397 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD53P19397 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD53P19397 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD53P19397 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD53P19397 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD53P19397 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD53P19397 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD53P19397 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD53P19397 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD53P19397 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD53P19397 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD53P19397 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD53P19397 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD53P19397 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD53P19397 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD53P19397 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD53P19397 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD53P19397 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD53P19397 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD53P19397 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD53P19397 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD53P19397 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD53P19397 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD53P19397 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD53P19397 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD53P19397 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD53P19397 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD53P19397 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD53P19397 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD53P19397 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD53P19397 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD53P19397 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD53P19397 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD53P19397 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD53P19397 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD53P19397 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD53P19397 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD53P19397 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD53P19397 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD53P19397 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD53P19397 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD53P19397 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD53P19397 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD53P19397 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD53P19397 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD53P19397 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD53P19397 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD53P19397 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD53P19397 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD53P19397 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD53P19397 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD53P19397 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD53P19397 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD53P19397 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD53P19397 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD53P19397 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD53P19397 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD53P19397 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD53P19397 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD53P19397 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD53P19397 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD53P19397 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD53P19397 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD53P19397 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD53P19397 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms