Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD44P16070 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD44P16070 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD44P16070 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD44P16070 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD44P16070 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD44P16070 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD44P16070 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD44P16070 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD44P16070 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD44P16070 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD44P16070 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD44P16070 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD44P16070 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CD44P16070 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD44P16070 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD44P16070 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD44P16070 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD44P16070 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CD44P16070 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD44P16070 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD44P16070 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD44P16070 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CD44P16070 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD44P16070 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD44P16070 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD44P16070 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD44P16070 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CD44P16070 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CD44P16070 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD44P16070 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD44P16070 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD44P16070 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD44P16070 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD44P16070 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CD44P16070 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD44P16070 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD44P16070 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD44P16070 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD44P16070 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CD44P16070 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD44P16070 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD44P16070 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CD44P16070 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD44P16070 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD44P16070 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD44P16070 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD44P16070 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CD44P16070 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD44P16070 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD44P16070 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD44P16070 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD44P16070 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD44P16070 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD44P16070 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD44P16070 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD44P16070 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD44P16070 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD44P16070 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD44P16070 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD44P16070 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD44P16070 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CD44P16070 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD44P16070 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD44P16070 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD44P16070 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD44P16070 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD44P16070 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD44P16070 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD44P16070 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD44P16070 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD44P16070 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD44P16070 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD44P16070 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD44P16070 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD44P16070 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD44P16070 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD44P16070 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD44P16070 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD44P16070 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD44P16070 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CD44P16070 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CD44P16070 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD44P16070 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD44P16070 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD44P16070 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD44P16070 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD44P16070 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD44P16070 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD44P16070 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD44P16070 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD44P16070 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD44P16070 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD44P16070 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD44P16070 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD44P16070 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD44P16070 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD44P16070 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD44P16070 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD44P16070 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms