Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MS4A1P11836 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MS4A1P11836 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MS4A1P11836 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
MS4A1P11836 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms