Protein–RNA interactions for Protein: P09486

SPARC, SPARC, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCP09486 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPARCP09486 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPARCP09486 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPARCP09486 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPARCP09486 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPARCP09486 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPARCP09486 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPARCP09486 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPARCP09486 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPARCP09486 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPARCP09486 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPARCP09486 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPARCP09486 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPARCP09486 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPARCP09486 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPARCP09486 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPARCP09486 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPARCP09486 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPARCP09486 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPARCP09486 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPARCP09486 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPARCP09486 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPARCP09486 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPARCP09486 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPARCP09486 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPARCP09486 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPARCP09486 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPARCP09486 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPARCP09486 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPARCP09486 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPARCP09486 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPARCP09486 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPARCP09486 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPARCP09486 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPARCP09486 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPARCP09486 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPARCP09486 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPARCP09486 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPARCP09486 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPARCP09486 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPARCP09486 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPARCP09486 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPARCP09486 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPARCP09486 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPARCP09486 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPARCP09486 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPARCP09486 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPARCP09486 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPARCP09486 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPARCP09486 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPARCP09486 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPARCP09486 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPARCP09486 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPARCP09486 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPARCP09486 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPARCP09486 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPARCP09486 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPARCP09486 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPARCP09486 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPARCP09486 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPARCP09486 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCP09486 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCP09486 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCP09486 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCP09486 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCP09486 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCP09486 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCP09486 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCP09486 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCP09486 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCP09486 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCP09486 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCP09486 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCP09486 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCP09486 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCP09486 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCP09486 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCP09486 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCP09486 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCP09486 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCP09486 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCP09486 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCP09486 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCP09486 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCP09486 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCP09486 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCP09486 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCP09486 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCP09486 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCP09486 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCP09486 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCP09486 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms