Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL3P08700 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL3P08700 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL3P08700 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IL3P08700 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IL3P08700 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IL3P08700 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IL3P08700 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL3P08700 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL3P08700 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL3P08700 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL3P08700 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL3P08700 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IL3P08700 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IL3P08700 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IL3P08700 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IL3P08700 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IL3P08700 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IL3P08700 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IL3P08700 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL3P08700 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL3P08700 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IL3P08700 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IL3P08700 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL3P08700 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL3P08700 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL3P08700 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL3P08700 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL3P08700 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL3P08700 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL3P08700 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL3P08700 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL3P08700 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL3P08700 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL3P08700 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL3P08700 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL3P08700 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL3P08700 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL3P08700 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL3P08700 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL3P08700 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL3P08700 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL3P08700 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL3P08700 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL3P08700 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL3P08700 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL3P08700 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IL3P08700 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL3P08700 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL3P08700 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL3P08700 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IL3P08700 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL3P08700 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL3P08700 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL3P08700 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL3P08700 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL3P08700 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL3P08700 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL3P08700 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL3P08700 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL3P08700 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL3P08700 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IL3P08700 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL3P08700 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL3P08700 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL3P08700 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL3P08700 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL3P08700 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IL3P08700 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL3P08700 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL3P08700 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IL3P08700 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IL3P08700 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IL3P08700 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL3P08700 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL3P08700 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL3P08700 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL3P08700 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL3P08700 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL3P08700 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL3P08700 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL3P08700 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IL3P08700 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IL3P08700 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IL3P08700 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL3P08700 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL3P08700 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL3P08700 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IL3P08700 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IL3P08700 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IL3P08700 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IL3P08700 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms