Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX3O95343 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX3O95343 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX3O95343 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX3O95343 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX3O95343 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX3O95343 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX3O95343 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX3O95343 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX3O95343 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX3O95343 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX3O95343 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX3O95343 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX3O95343 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX3O95343 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX3O95343 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX3O95343 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX3O95343 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX3O95343 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX3O95343 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX3O95343 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX3O95343 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX3O95343 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX3O95343 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX3O95343 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX3O95343 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX3O95343 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX3O95343 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX3O95343 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX3O95343 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX3O95343 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX3O95343 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX3O95343 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX3O95343 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX3O95343 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX3O95343 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX3O95343 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX3O95343 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX3O95343 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX3O95343 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX3O95343 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX3O95343 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX3O95343 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX3O95343 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX3O95343 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX3O95343 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX3O95343 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX3O95343 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX3O95343 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX3O95343 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX3O95343 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX3O95343 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX3O95343 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX3O95343 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX3O95343 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX3O95343 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX3O95343 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX3O95343 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX3O95343 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX3O95343 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX3O95343 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX3O95343 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX3O95343 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX3O95343 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX3O95343 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX3O95343 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX3O95343 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX3O95343 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX3O95343 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX3O95343 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX3O95343 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX3O95343 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX3O95343 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX3O95343 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX3O95343 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX3O95343 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX3O95343 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX3O95343 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX3O95343 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX3O95343 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX3O95343 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX3O95343 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX3O95343 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX3O95343 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX3O95343 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX3O95343 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX3O95343 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX3O95343 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX3O95343 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX3O95343 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX3O95343 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX3O95343 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX3O95343 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX3O95343 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX3O95343 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX3O95343 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX3O95343 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX3O95343 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX3O95343 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX3O95343 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms