Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAPBO95292 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAPBO95292 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAPBO95292 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAPBO95292 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAPBO95292 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAPBO95292 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAPBO95292 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAPBO95292 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAPBO95292 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAPBO95292 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VAPBO95292 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAPBO95292 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAPBO95292 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAPBO95292 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAPBO95292 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAPBO95292 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAPBO95292 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAPBO95292 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAPBO95292 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAPBO95292 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAPBO95292 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAPBO95292 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAPBO95292 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAPBO95292 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAPBO95292 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAPBO95292 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAPBO95292 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAPBO95292 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAPBO95292 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAPBO95292 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAPBO95292 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAPBO95292 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VAPBO95292 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VAPBO95292 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAPBO95292 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAPBO95292 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAPBO95292 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VAPBO95292 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAPBO95292 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAPBO95292 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAPBO95292 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAPBO95292 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAPBO95292 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAPBO95292 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAPBO95292 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VAPBO95292 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAPBO95292 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAPBO95292 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAPBO95292 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAPBO95292 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAPBO95292 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAPBO95292 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAPBO95292 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAPBO95292 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAPBO95292 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAPBO95292 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAPBO95292 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAPBO95292 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAPBO95292 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAPBO95292 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAPBO95292 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAPBO95292 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAPBO95292 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAPBO95292 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAPBO95292 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAPBO95292 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAPBO95292 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VAPBO95292 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAPBO95292 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAPBO95292 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAPBO95292 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAPBO95292 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAPBO95292 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAPBO95292 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAPBO95292 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAPBO95292 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAPBO95292 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAPBO95292 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAPBO95292 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAPBO95292 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAPBO95292 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAPBO95292 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAPBO95292 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAPBO95292 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAPBO95292 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAPBO95292 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAPBO95292 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAPBO95292 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAPBO95292 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAPBO95292 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAPBO95292 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms