Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC31AO94979 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC31AO94979 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31AO94979 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31AO94979 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31AO94979 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC31AO94979 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC31AO94979 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC31AO94979 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC31AO94979 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms