Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP1O94782 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP1O94782 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP1O94782 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP1O94782 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP1O94782 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP1O94782 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP1O94782 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP1O94782 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP1O94782 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP1O94782 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP1O94782 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP1O94782 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP1O94782 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP1O94782 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP1O94782 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP1O94782 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP1O94782 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP1O94782 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP1O94782 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP1O94782 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP1O94782 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP1O94782 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP1O94782 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP1O94782 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP1O94782 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP1O94782 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP1O94782 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP1O94782 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP1O94782 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP1O94782 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP1O94782 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP1O94782 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP1O94782 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP1O94782 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP1O94782 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP1O94782 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP1O94782 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP1O94782 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP1O94782 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP1O94782 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP1O94782 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP1O94782 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP1O94782 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP1O94782 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP1O94782 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP1O94782 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP1O94782 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP1O94782 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP1O94782 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP1O94782 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP1O94782 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP1O94782 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP1O94782 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP1O94782 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP1O94782 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP1O94782 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP1O94782 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP1O94782 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP1O94782 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP1O94782 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP1O94782 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP1O94782 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP1O94782 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP1O94782 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP1O94782 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP1O94782 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP1O94782 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP1O94782 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP1O94782 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP1O94782 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP1O94782 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP1O94782 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP1O94782 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP1O94782 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP1O94782 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP1O94782 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP1O94782 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP1O94782 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP1O94782 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP1O94782 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP1O94782 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP1O94782 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP1O94782 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP1O94782 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP1O94782 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP1O94782 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP1O94782 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP1O94782 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP1O94782 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP1O94782 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP1O94782 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms