Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP2O75563 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP2O75563 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP2O75563 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms