Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ULK1O75385 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ULK1O75385 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ULK1O75385 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK1O75385 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK1O75385 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK1O75385 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK1O75385 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ULK1O75385 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ULK1O75385 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ULK1O75385 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ULK1O75385 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ULK1O75385 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK1O75385 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK1O75385 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK1O75385 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK1O75385 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK1O75385 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK1O75385 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK1O75385 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK1O75385 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK1O75385 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ULK1O75385 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ULK1O75385 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ULK1O75385 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ULK1O75385 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ULK1O75385 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ULK1O75385 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ULK1O75385 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ULK1O75385 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK1O75385 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK1O75385 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK1O75385 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK1O75385 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK1O75385 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK1O75385 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK1O75385 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK1O75385 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK1O75385 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK1O75385 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK1O75385 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK1O75385 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK1O75385 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK1O75385 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK1O75385 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK1O75385 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK1O75385 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK1O75385 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ULK1O75385 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ULK1O75385 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ULK1O75385 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ULK1O75385 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ULK1O75385 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ULK1O75385 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ULK1O75385 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK1O75385 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK1O75385 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK1O75385 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK1O75385 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK1O75385 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK1O75385 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK1O75385 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK1O75385 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK1O75385 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK1O75385 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK1O75385 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK1O75385 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ULK1O75385 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ULK1O75385 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ULK1O75385 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ULK1O75385 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ULK1O75385 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ULK1O75385 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ULK1O75385 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ULK1O75385 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK1O75385 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK1O75385 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK1O75385 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK1O75385 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ULK1O75385 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ULK1O75385 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ULK1O75385 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ULK1O75385 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ULK1O75385 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ULK1O75385 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ULK1O75385 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK1O75385 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK1O75385 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK1O75385 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ULK1O75385 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ULK1O75385 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ULK1O75385 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ULK1O75385 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK1O75385 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK1O75385 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK1O75385 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ULK1O75385 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ULK1O75385 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK1O75385 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK1O75385 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms