Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN2O75298 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN2O75298 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN2O75298 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN2O75298 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN2O75298 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN2O75298 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN2O75298 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN2O75298 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN2O75298 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN2O75298 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN2O75298 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN2O75298 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN2O75298 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN2O75298 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN2O75298 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN2O75298 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN2O75298 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN2O75298 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN2O75298 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTN2O75298 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN2O75298 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN2O75298 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN2O75298 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN2O75298 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN2O75298 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN2O75298 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN2O75298 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN2O75298 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN2O75298 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN2O75298 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN2O75298 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN2O75298 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN2O75298 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN2O75298 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN2O75298 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN2O75298 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN2O75298 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN2O75298 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN2O75298 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN2O75298 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN2O75298 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN2O75298 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN2O75298 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN2O75298 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN2O75298 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN2O75298 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN2O75298 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN2O75298 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN2O75298 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN2O75298 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN2O75298 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN2O75298 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN2O75298 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN2O75298 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN2O75298 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN2O75298 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN2O75298 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN2O75298 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN2O75298 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN2O75298 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN2O75298 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN2O75298 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RTN2O75298 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RTN2O75298 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN2O75298 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN2O75298 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN2O75298 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN2O75298 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN2O75298 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN2O75298 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN2O75298 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN2O75298 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN2O75298 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN2O75298 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN2O75298 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN2O75298 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN2O75298 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN2O75298 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN2O75298 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN2O75298 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN2O75298 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN2O75298 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN2O75298 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN2O75298 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN2O75298 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN2O75298 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN2O75298 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN2O75298 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN2O75298 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN2O75298 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.6 ms