Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KERAO60938 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KERAO60938 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KERAO60938 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KERAO60938 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KERAO60938 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KERAO60938 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KERAO60938 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KERAO60938 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KERAO60938 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KERAO60938 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KERAO60938 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KERAO60938 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KERAO60938 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KERAO60938 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KERAO60938 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KERAO60938 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KERAO60938 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KERAO60938 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KERAO60938 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KERAO60938 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KERAO60938 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KERAO60938 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KERAO60938 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KERAO60938 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KERAO60938 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KERAO60938 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KERAO60938 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KERAO60938 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KERAO60938 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KERAO60938 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KERAO60938 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KERAO60938 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KERAO60938 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KERAO60938 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KERAO60938 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KERAO60938 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KERAO60938 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KERAO60938 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KERAO60938 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KERAO60938 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KERAO60938 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KERAO60938 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KERAO60938 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KERAO60938 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KERAO60938 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KERAO60938 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KERAO60938 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KERAO60938 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KERAO60938 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KERAO60938 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KERAO60938 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KERAO60938 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KERAO60938 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KERAO60938 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KERAO60938 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KERAO60938 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KERAO60938 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KERAO60938 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KERAO60938 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KERAO60938 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KERAO60938 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KERAO60938 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KERAO60938 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KERAO60938 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KERAO60938 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KERAO60938 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KERAO60938 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KERAO60938 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KERAO60938 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KERAO60938 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KERAO60938 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KERAO60938 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KERAO60938 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KERAO60938 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KERAO60938 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KERAO60938 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KERAO60938 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KERAO60938 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KERAO60938 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KERAO60938 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KERAO60938 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KERAO60938 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KERAO60938 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KERAO60938 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KERAO60938 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KERAO60938 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KERAO60938 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KERAO60938 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KERAO60938 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KERAO60938 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms