Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACTN4O43707 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACTN4O43707 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACTN4O43707 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN4O43707 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms