Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB6O15197 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB6O15197 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB6O15197 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB6O15197 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB6O15197 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB6O15197 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB6O15197 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB6O15197 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB6O15197 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EPHB6O15197 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
EPHB6O15197 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms