Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX16-NPEPL1H3BU86 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
STX16-NPEPL1H3BU86 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX16-NPEPL1H3BU86 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms