Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIF28PB7ZC32 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIF28PB7ZC32 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF28PB7ZC32 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF28PB7ZC32 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF28PB7ZC32 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIF28PB7ZC32 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIF28PB7ZC32 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF28PB7ZC32 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF28PB7ZC32 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KIF28PB7ZC32 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIF28PB7ZC32 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KIF28PB7ZC32 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms