Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
KIF28PB7ZC32 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
KIF28PB7ZC32 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
KIF28PB7ZC32 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
KIF28PB7ZC32 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KIF28PB7ZC32 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KIF28PB7ZC32 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KIF28PB7ZC32 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KIF28PB7ZC32 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KIF28PB7ZC32 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KIF28PB7ZC32 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF28PB7ZC32 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KIF28PB7ZC32 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIF28PB7ZC32 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIF28PB7ZC32 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIF28PB7ZC32 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIF28PB7ZC32 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KIF28PB7ZC32 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KIF28PB7ZC32 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KIF28PB7ZC32 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KIF28PB7ZC32 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIF28PB7ZC32 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KIF28PB7ZC32 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KIF28PB7ZC32 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KIF28PB7ZC32 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIF28PB7ZC32 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KIF28PB7ZC32 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KIF28PB7ZC32 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KIF28PB7ZC32 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
KIF28PB7ZC32 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIF28PB7ZC32 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KIF28PB7ZC32 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIF28PB7ZC32 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIF28PB7ZC32 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIF28PB7ZC32 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KIF28PB7ZC32 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIF28PB7ZC32 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIF28PB7ZC32 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIF28PB7ZC32 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KIF28PB7ZC32 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KIF28PB7ZC32 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIF28PB7ZC32 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIF28PB7ZC32 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIF28PB7ZC32 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KIF28PB7ZC32 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KIF28PB7ZC32 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KIF28PB7ZC32 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIF28PB7ZC32 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIF28PB7ZC32 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIF28PB7ZC32 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIF28PB7ZC32 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIF28PB7ZC32 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KIF28PB7ZC32 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KIF28PB7ZC32 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KIF28PB7ZC32 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KIF28PB7ZC32 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KIF28PB7ZC32 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KIF28PB7ZC32 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIF28PB7ZC32 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
KIF28PB7ZC32 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIF28PB7ZC32 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIF28PB7ZC32 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KIF28PB7ZC32 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF28PB7ZC32 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIF28PB7ZC32 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIF28PB7ZC32 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KIF28PB7ZC32 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KIF28PB7ZC32 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF28PB7ZC32 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIF28PB7ZC32 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF28PB7ZC32 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIF28PB7ZC32 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF28PB7ZC32 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF28PB7ZC32 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF28PB7ZC32 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KIF28PB7ZC32 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KIF28PB7ZC32 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIF28PB7ZC32 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIF28PB7ZC32 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KIF28PB7ZC32 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIF28PB7ZC32 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KIF28PB7ZC32 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KIF28PB7ZC32 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KIF28PB7ZC32 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIF28PB7ZC32 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KIF28PB7ZC32 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIF28PB7ZC32 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIF28PB7ZC32 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIF28PB7ZC32 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KIF28PB7ZC32 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KIF28PB7ZC32 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIF28PB7ZC32 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KIF28PB7ZC32 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
KIF28PB7ZC32 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
KIF28PB7ZC32 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIF28PB7ZC32 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIF28PB7ZC32 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIF28PB7ZC32 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
KIF28PB7ZC32 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIF28PB7ZC32 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms