Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN24A6NM45 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN24A6NM45 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN24A6NM45 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms