Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVI7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVI7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVI7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVI7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1B0GVI7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVI7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms