Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV27A0A087WT01 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAV27A0A087WT01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV27A0A087WT01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms