Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35P42766 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms