Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB2A8KAH6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB2A8KAH6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms