RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438413.5

MUC1-211, Transcript of mucin 1, cell surface associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MUC1, Length 927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1-211ENST00000438413 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.27■■■■■ 5.32
MUC1-211ENST00000438413 ABCC9O60706 1549 aa43.53■■■■■ 4.56
MUC1-211ENST00000438413 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.44■■■■■ 4.55
MUC1-211ENST00000438413 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.4■■■■■ 4.22
MUC1-211ENST00000438413 NACADO15069 1562 aa41.07■■■■■ 4.16
MUC1-211ENST00000438413 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.91■■■■■ 4.14
MUC1-211ENST00000438413 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.77■■■■■ 4.12
MUC1-211ENST00000438413 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.52■■■■■ 4.08
MUC1-211ENST00000438413 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.46■■■■■ 4.07
MUC1-211ENST00000438413 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.44■■■■■ 4.06
MUC1-211ENST00000438413 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.19■■■■■ 4.02
MUC1-211ENST00000438413 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
MUC1-211ENST00000438413 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.87■■■■□ 3.97
MUC1-211ENST00000438413 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.63■■■■□ 3.94
MUC1-211ENST00000438413 SCRIBQ14160 1630 aa39.55■■■■□ 3.92
MUC1-211ENST00000438413 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.34■■■■□ 3.89
MUC1-211ENST00000438413 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.23■■■■□ 3.87
MUC1-211ENST00000438413 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
MUC1-211ENST00000438413 NCAPD3P42695 1498 aa37.89■■■■□ 3.66
MUC1-211ENST00000438413 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.75■■■■□ 3.63
MUC1-211ENST00000438413 SMARCA4P51532 1647 aa37.72■■■■□ 3.63
MUC1-211ENST00000438413 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.68■■■■□ 3.62
MUC1-211ENST00000438413 SMARCA2P51531 1590 aa37.67■■■■□ 3.62
MUC1-211ENST00000438413 HMGXB3Q12766 1538 aa37.63■■■■□ 3.61
MUC1-211ENST00000438413 ERCC6Q03468 1493 aa37.6■■■■□ 3.61
MUC1-211ENST00000438413 CUX2O14529 1486 aa37.58■■■■□ 3.61
MUC1-211ENST00000438413 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
MUC1-211ENST00000438413 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
MUC1-211ENST00000438413 NESP48681 1621 aa37.36■■■■□ 3.57
MUC1-211ENST00000438413 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.34■■■■□ 3.57
MUC1-211ENST00000438413 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.2■■■■□ 3.55
MUC1-211ENST00000438413 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.1■■■■□ 3.53
MUC1-211ENST00000438413 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
MUC1-211ENST00000438413 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.93■■■■□ 3.5
MUC1-211ENST00000438413 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.85■■■■□ 3.49
MUC1-211ENST00000438413 WIZO95785 1651 aa36.77■■■■□ 3.48
MUC1-211ENST00000438413 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.71■■■■□ 3.47
MUC1-211ENST00000438413 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.56■■■■□ 3.44
MUC1-211ENST00000438413 WDR62O43379 1518 aa36.49■■■■□ 3.43
MUC1-211ENST00000438413 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.39■■■■□ 3.42
MUC1-211ENST00000438413 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
MUC1-211ENST00000438413 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.32■■■■□ 3.41
MUC1-211ENST00000438413 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
MUC1-211ENST00000438413 CFTRP13569 1480 aa36.28■■■■□ 3.4
MUC1-211ENST00000438413 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
MUC1-211ENST00000438413 PRDM2Q13029 1718 aa36.01■■■■□ 3.36
MUC1-211ENST00000438413 TRIM41Q8WV44 630 aa35.99■■■■□ 3.35
MUC1-211ENST00000438413 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.85■■■■□ 3.33
MUC1-211ENST00000438413 OSCARQ8IYS5 282 aa35.8■■■■□ 3.32
MUC1-211ENST00000438413 IFT140Q96RY7 1462 aa35.65■■■■□ 3.3
MUC1-211ENST00000438413 TOPBP1Q92547 1522 aa35.62■■■■□ 3.29
MUC1-211ENST00000438413 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
MUC1-211ENST00000438413 ABCC8Q09428 1581 aa35.54■■■■□ 3.28
MUC1-211ENST00000438413 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.51■■■■□ 3.27
MUC1-211ENST00000438413 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
MUC1-211ENST00000438413 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
MUC1-211ENST00000438413 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
MUC1-211ENST00000438413 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
MUC1-211ENST00000438413 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
MUC1-211ENST00000438413 ARHGEF11O15085 1522 aa35.27■■■■□ 3.24
MUC1-211ENST00000438413 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.26■■■■□ 3.23
MUC1-211ENST00000438413 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
MUC1-211ENST00000438413 CHD1O14646 1710 aa35.24■■■■□ 3.23
MUC1-211ENST00000438413 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.12■■■■□ 3.21
MUC1-211ENST00000438413 SOGA1O94964 1423 aa35.06■■■■□ 3.2
MUC1-211ENST00000438413 FBLN2P98095 1184 aa35.05■■■■□ 3.2
MUC1-211ENST00000438413 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.02■■■■□ 3.2
MUC1-211ENST00000438413 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
MUC1-211ENST00000438413 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.98■■■■□ 3.19
MUC1-211ENST00000438413 WDR97A6NE52 1622 aa34.98■■■■□ 3.19
MUC1-211ENST00000438413 CUX1P39880 1505 aa34.96■■■■□ 3.19
MUC1-211ENST00000438413 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.92■■■■□ 3.18
MUC1-211ENST00000438413 ARAP1Q96P48 1450 aa34.9■■■■□ 3.18
MUC1-211ENST00000438413 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
MUC1-211ENST00000438413 GRIN2BQ13224 1484 aa34.79■■■■□ 3.16
MUC1-211ENST00000438413 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.79■■■■□ 3.16
MUC1-211ENST00000438413 SYNJ1O43426 1573 aa34.77■■■■□ 3.16
MUC1-211ENST00000438413 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
MUC1-211ENST00000438413 PBRM1Q86U86 1689 aa34.73■■■■□ 3.15
MUC1-211ENST00000438413 SYNJ2O15056 1496 aa34.71■■■■□ 3.15
MUC1-211ENST00000438413 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
MUC1-211ENST00000438413 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.65■■■■□ 3.14
MUC1-211ENST00000438413 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
MUC1-211ENST00000438413 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.6■■■■□ 3.13
MUC1-211ENST00000438413 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.6■■■■□ 3.13
MUC1-211ENST00000438413 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
MUC1-211ENST00000438413 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.41■■■■□ 3.1
MUC1-211ENST00000438413 TOP2BQ02880 1626 aa34.38■■■■□ 3.09
MUC1-211ENST00000438413 GRIN2AQ12879 1464 aa34.37■■■■□ 3.09
MUC1-211ENST00000438413 ADAMTS12P58397 1594 aa34.35■■■■□ 3.09
MUC1-211ENST00000438413 CEP170Q5SW79 1584 aa34.26■■■■□ 3.07
MUC1-211ENST00000438413 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.23■■■■□ 3.07
MUC1-211ENST00000438413 NUP160Q12769 1436 aa34.23■■■■□ 3.07
MUC1-211ENST00000438413 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.2■■■■□ 3.06
MUC1-211ENST00000438413 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.18■■■■□ 3.06
MUC1-211ENST00000438413 SHROOM2Q13796 1616 aa34.15■■■■□ 3.06
MUC1-211ENST00000438413 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
MUC1-211ENST00000438413 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.88■■■■□ 3.01
MUC1-211ENST00000438413 JPH4Q96JJ6 628 aa33.85■■■■□ 3.01
MUC1-211ENST00000438413 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.79■■■■□ 3
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