Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSTD2-201ENST00000341170 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC11A2-205ENST00000545993 1937 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 NIPAL1-201ENST00000295461 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPEB1-207ENST00000611031 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOB1A-201ENST00000396049 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM32-201ENST00000379907 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEFM-203ENST00000437366 3148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPAR3-202ENST00000440886 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R26P3-201ENST00000612861 3800 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANAPC16-201ENST00000299381 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXJ2-202ENST00000428177 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDILT-201ENST00000302451 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL5A2-203ENST00000618828 6399 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDC37L1-201ENST00000381854 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARID1B-230ENST00000637810 5073 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRISPLD2-201ENST00000262424 4586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTN2A2-203ENST00000416795 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARD3B-202ENST00000351153 3411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 BNC2-210ENST00000545497 3750 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARD14-201ENST00000344227 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD22-202ENST00000341773 2755 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL162274.3-201ENST00000623138 3109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1683-206ENST00000600328 3819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEX1-203ENST00000428214 3681 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1257-201ENST00000265068 6034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLRA4-201ENST00000372617 1795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF589-201ENST00000354698 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF19-201ENST00000376255 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACSBG2-210ENST00000591403 2690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 DOCK2-201ENST00000256935 6097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 MORC1-201ENST00000232603 3764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R3C-201ENST00000238994 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDPD2-201ENST00000374382 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRICKLE1-205ENST00000548696 3635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR2M-201ENST00000299638 4199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092447.8-201ENST00000566570 4162 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.9 ms