Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP9-4Q9BYQ2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-4Q9BYQ2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms