Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJC4Q9NNZ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms