RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270560.3

TM4SF5-201, Transcript of transmembrane 4 L six family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM4SF5, Length 708 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5-201ENST00000270560 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.25■■■■■ 5.63
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TM4SF5-201ENST00000270560 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.97■■■■■ 4.31
TM4SF5-201ENST00000270560 NACADO15069 1562 aa41.97■■■■■ 4.31
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TM4SF5-201ENST00000270560 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.78■■■■■ 4.28
TM4SF5-201ENST00000270560 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.59■■■■■ 4.25
TM4SF5-201ENST00000270560 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.85■■■■■ 4.13
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TM4SF5-201ENST00000270560 SCRIBQ14160 1630 aa40.67■■■■■ 4.1
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TM4SF5-201ENST00000270560 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.77■■■■□ 3.8
TM4SF5-201ENST00000270560 SMARCA2P51531 1590 aa38.71■■■■□ 3.79
TM4SF5-201ENST00000270560 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.7■■■■□ 3.79
TM4SF5-201ENST00000270560 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.58■■■■□ 3.77
TM4SF5-201ENST00000270560 HMGXB3Q12766 1538 aa38.53■■■■□ 3.76
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TM4SF5-201ENST00000270560 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.67■■■■□ 3.62
TM4SF5-201ENST00000270560 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.65■■■■□ 3.62
TM4SF5-201ENST00000270560 ERCC6Q03468 1493 aa37.62■■■■□ 3.61
TM4SF5-201ENST00000270560 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.49■■■■□ 3.59
TM4SF5-201ENST00000270560 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.46■■■■□ 3.59
TM4SF5-201ENST00000270560 CFTRP13569 1480 aa37.42■■■■□ 3.58
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TM4SF5-201ENST00000270560 CUX2O14529 1486 aa37.21■■■■□ 3.55
TM4SF5-201ENST00000270560 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.21■■■■□ 3.55
TM4SF5-201ENST00000270560 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.17■■■■□ 3.54
TM4SF5-201ENST00000270560 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
TM4SF5-201ENST00000270560 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.12■■■■□ 3.53
TM4SF5-201ENST00000270560 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.07■■■■□ 3.52
TM4SF5-201ENST00000270560 PRDM2Q13029 1718 aa36.93■■■■□ 3.5
TM4SF5-201ENST00000270560 WDR62O43379 1518 aa36.92■■■■□ 3.5
TM4SF5-201ENST00000270560 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
TM4SF5-201ENST00000270560 ABCC8Q09428 1581 aa36.61■■■■□ 3.45
TM4SF5-201ENST00000270560 TOPBP1Q92547 1522 aa36.57■■■■□ 3.44
TM4SF5-201ENST00000270560 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.52■■■■□ 3.44
TM4SF5-201ENST00000270560 IFT140Q96RY7 1462 aa36.36■■■■□ 3.41
TM4SF5-201ENST00000270560 CUX1P39880 1505 aa36.3■■■■□ 3.4
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TM4SF5-201ENST00000270560 SOGA1O94964 1423 aa36.16■■■■□ 3.38
TM4SF5-201ENST00000270560 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
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TM4SF5-201ENST00000270560 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.11■■■■□ 3.37
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TM4SF5-201ENST00000270560 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.95■■■■□ 3.35
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TM4SF5-201ENST00000270560 OSCARQ8IYS5 282 aa35.73■■■■□ 3.31
TM4SF5-201ENST00000270560 GRIN2BQ13224 1484 aa35.73■■■■□ 3.31
TM4SF5-201ENST00000270560 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.73■■■■□ 3.31
TM4SF5-201ENST00000270560 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.65■■■■□ 3.3
TM4SF5-201ENST00000270560 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.63■■■■□ 3.29
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TM4SF5-201ENST00000270560 PBRM1Q86U86 1689 aa35.5■■■■□ 3.27
TM4SF5-201ENST00000270560 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
TM4SF5-201ENST00000270560 SYNJ2O15056 1496 aa35.48■■■■□ 3.27
TM4SF5-201ENST00000270560 CHD1O14646 1710 aa35.43■■■■□ 3.26
TM4SF5-201ENST00000270560 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.42■■■■□ 3.26
TM4SF5-201ENST00000270560 KIF27Q86VH2 1401 aa35.4■■■■□ 3.26
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TM4SF5-201ENST00000270560 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.33■■■■□ 3.25
TM4SF5-201ENST00000270560 ADAMTS12P58397 1594 aa35.31■■■■□ 3.24
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TM4SF5-201ENST00000270560 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.04■■■■□ 3.2
TM4SF5-201ENST00000270560 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.02■■■■□ 3.2
TM4SF5-201ENST00000270560 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.02■■■■□ 3.2
TM4SF5-201ENST00000270560 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.02■■■■□ 3.2
TM4SF5-201ENST00000270560 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.01■■■■□ 3.2
TM4SF5-201ENST00000270560 CEP170Q5SW79 1584 aa35.01■■■■□ 3.2
TM4SF5-201ENST00000270560 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.94■■■■□ 3.18
TM4SF5-201ENST00000270560 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.82■■■■□ 3.16
TM4SF5-201ENST00000270560 ARAP1Q96P48 1450 aa34.8■■■■□ 3.16
TM4SF5-201ENST00000270560 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.8■■■■□ 3.16
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