Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.031e-7■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-7■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 PABPC4-219ENST00000525045 765 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-7■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 PABPC4-212ENST00000477556 413 ntTSL 314.64□□□□□ -0.071e-7■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 PABPC4-209ENST00000468476 3592 ntTSL 29.03□□□□□ -0.961e-7■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 VCL-206ENST00000623461 7995 ntTSL 1 (best)8.79□□□□□ -12e-14■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 ANXA11-207ENST00000463340 377 ntTSL 35.7□□□□□ -1.52e-14■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.914e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.844e-6■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 PQLC1-212ENST00000590895 865 ntTSL 318.69■□□□□ 0.584e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 218.56■□□□□ 0.564e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 217.09■□□□□ 0.334e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 PQLC1-205ENST00000469369 593 ntTSL 414.98□□□□□ -0.014e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 PQLC1-209ENST00000589000 558 ntTSL 412.81□□□□□ -0.364e-6■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.83e-10■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 SLC25A6-202ENST00000475167 900 ntTSL 217.83■□□□□ 0.443e-10■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 SLC25A6-203ENST00000484026 854 ntTSL 514.57□□□□□ -0.083e-10■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 SMARCC2-214ENST00000552674 3730 ntTSL 29.31□□□□□ -0.921e-6■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 APOA2-209ENST00000481511 655 ntTSL 514□□□□□ -0.173e-46■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.533e-46■■■□□ 15.9
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PCBP1Q15365 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.633e-46■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.93e-46■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 528.6■■■□□ 2.178e-11■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 HDAC2-207ENST00000520170 690 ntTSL 222.27■■□□□ 1.163e-25■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.931e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.893e-25■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-7■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 316.99■□□□□ 0.318e-11■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-7■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 CTNND1-224ENST00000530068 579 ntTSL 412.44□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 311.91□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.553e-25■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 HDAC2-210ENST00000521163 557 ntTSL 510.97□□□□□ -0.653e-25■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 CTNND1-209ENST00000524579 505 ntTSL 46.78□□□□□ -1.322e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 HDAC2-213ENST00000522371 502 ntTSL 44.56□□□□□ -1.683e-25■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.076e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.953e-11■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 C2-212ENST00000482060 2335 ntTSL 212.61□□□□□ -0.392e-9■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 11e-33■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.031e-33■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.541e-33■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.99e-9■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.419e-9■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 RTKN-211ENST00000640304 612 ntTSL 516.52■□□□□ 0.249e-9■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.149e-9■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-28■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 329.52■■■□□ 2.329e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 229.52■■■□□ 2.329e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMEM259-208ENST00000592052 1637 nt27.32■■□□□ 1.961e-15■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMED7-203ENST00000508420 572 ntTSL 425.4■■□□□ 1.666e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 524.45■■□□□ 1.59e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ARFGEF1-206ENST00000519436 571 ntTSL 323.63■■□□□ 1.376e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.156e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PLD3-224ENST00000602131 503 ntTSL 221.28■■□□□ 16e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PLXNA3-205ENST00000482598 280 ntTSL 319.89■□□□□ 0.776e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.736e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.726e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.716e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PLD3-211ENST00000485448 1308 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.686e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.586e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PLD3-220ENST00000599353 332 ntTSL 318.53■□□□□ 0.566e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PI4KA-202ENST00000399213 1636 ntTSL 518.16■□□□□ 0.56e-7■■■□□ 15.8
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